Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms