Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms