Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms