Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms