Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHMP1BQ7LBR1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms