Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP31Q70CQ4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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