Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRPF38BQ5VTL8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRPF38BQ5VTL8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms