Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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SCN9AQ15858 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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SCN9AQ15858 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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SCN9AQ15858 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN9AQ15858 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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