Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms