Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H3Q13889 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms