Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLCSP50747 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLCSP50747 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLCSP50747 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLCSP50747 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLCSP50747 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLCSP50747 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLCSP50747 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLCSP50747 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLCSP50747 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLCSP50747 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLCSP50747 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLCSP50747 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLCSP50747 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLCSP50747 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLCSP50747 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLCSP50747 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLCSP50747 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLCSP50747 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLCSP50747 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLCSP50747 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLCSP50747 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms