Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms