Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifna5P07349 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms