Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFDQ9GZP0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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