Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM5Q9C035 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM5Q9C035 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM5Q9C035 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM5Q9C035 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM5Q9C035 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM5Q9C035 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM5Q9C035 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms