Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms