Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGF29Q96ES7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms