Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
USP9XQ93008 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP9XQ93008 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP9XQ93008 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms