Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01559Q495D7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms