Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1EQ15878 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms