Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms