Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHDQ02161 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHDQ02161 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHDQ02161 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHDQ02161 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHDQ02161 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHDQ02161 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHDQ02161 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHDQ02161 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHDQ02161 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHDQ02161 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms