Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAG2P55895 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms