Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms