Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLIT2O94813 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLIT2O94813 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms