Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
B4DXG7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B4DXG7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B4DXG7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms