Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM5B3KS81 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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