Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms