Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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