Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms