Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCC13Q9NSE7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms