Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms