Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms