Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms