Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRG4Q92954 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms