Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r200Q8R281 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms