Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms