Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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