Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA2Q15822 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA2Q15822 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms