Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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