Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms