Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX6-1P78426 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms