Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCCP23508 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCP23508 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCP23508 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCP23508 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms