Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMY2BP19961 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMY2BP19961 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms