Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD8BP10966 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms