Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRTO14522 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRTO14522 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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