Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ror1Q9Z139 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ror1Q9Z139 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ror1Q9Z139 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ror1Q9Z139 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ror1Q9Z139 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ror1Q9Z139 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ror1Q9Z139 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ror1Q9Z139 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ror1Q9Z139 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms