Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphs1Q9QZS7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphs1Q9QZS7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphs1Q9QZS7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphs1Q9QZS7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphs1Q9QZS7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphs1Q9QZS7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphs1Q9QZS7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphs1Q9QZS7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms