Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrotQ9DC50 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrotQ9DC50 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CrotQ9DC50 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrotQ9DC50 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrotQ9DC50 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrotQ9DC50 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms