Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisa9Q9CZN4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisa9Q9CZN4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms